แม้ว่าไฮโต เอ็นเนอร์จีจะมุ่งเน้นหลักในเทคโนโลยีเซลล์เชื้อเพลิงเป็นหลัก แต่เครื่องยนต์เผาไหม้ไฮโดรเจนก็ถือเป็นอีกทางเลือกหนึ่งของการใช้ไฮโดรเจนเป็นเชื้อเพลิง โดยโซลูชันการผลิตและจัดเก็บไฮโดรเจนของเราสามารถสนับสนุนการพัฒนาด้านนี้ได้ เครื่องยนต์เหล่านี้ทำงานในลักษณะเดียวกันกับเครื่องยนต์สันดาปภายในแบบดั้งเดิม แต่ใช้ก๊าซไฮโดรเจนแทนน้ำมันเบนซินหรือดีเซล โดยปล่อยไอน้ำเป็นหลัก (มีไนโตรเจนออกไซด์ในปริมาณเล็กน้อยหากใช้อากาศ) และยังเป็นเทคโนโลยีที่คุ้นเคยและสามารถขยายขนาดได้สำหรับการลดคาร์บอน เครื่องยนต์เผาไหม้ไฮโดรเจนมีข้อได้เปรียบจากการมีโครงสร้างพื้นฐานการผลิตที่มีอยู่เดิม ทำให้ง่ายต่อการนำไปใช้ร่วมกับสายการผลิตรถยนต์ปัจจุบันเมื่อเทียบกับเซลล์เชื้อเพลิง สามารถใช้ไฮโดรเจนสีเขียวที่ผลิตผ่านอิเล็กโทรไลเซอร์ของไฮโต้ ทำให้มั่นใจได้ว่ามีการปล่อยมลพิษตลอดวงจรชีวิตต่ำ อย่างไรก็ตาม เครื่องยนต์เหล่านี้มีประสิทธิภาพต่ำกว่าเซลล์เชื้อเพลิง (แปลงพลังงานไฮโดรเจนเป็นพลังงานกลไกได้ประมาณ 20-35% เมื่อเทียบกับ 40-60% สำหรับเซลล์เชื้อเพลิง) และต้องการการปรับเปลี่ยนเพื่อจัดการกับช่วงการติดไฟกว้างของไฮโดรเจนและความสามารถในการหล่อลื่นต่ำ ถังไฮโดรเจนความดันสูงของไฮโต้ (35MPa/70MPa) เข้ากันได้กับเครื่องยนต์เหล่านี้ ให้ความจุในการจัดเก็บที่เพียงพอสำหรับระยะทางของรถยนต์ที่เทียบเท่ากับรถยนต์ที่ใช้น้ำมันเบนซิน แม้ว่าเซลล์เชื้อเพลิงจะยังคงเป็นจุดมุ่งหมายหลักของไฮโต้ในด้านการใช้งานที่มีประสิทธิภาพสูง แต่เครื่องยนต์เผาไหม้ไฮโดรเจนก็เป็นทางเลือกชั่วคราวสำหรับภาคส่วนต่างๆ เช่น รถบรรทุกหนัก ที่จำเป็นต้องลดคาร์บอนทันที โดยการจัดหาไฮโดรเจนสะอาดและโซลูชันการจัดเก็บ ไฮโต้จึงสนับสนุนระบบขับเคลื่อนด้วยพลังงานไฮโดรเจนที่หลากหลาย ทำให้มั่นใจได้ถึงความยืดหยุ่นในการเปลี่ยนผ่านด้านพลังงาน