Hydrogen xanh là nhiên liệu vận chuyển lý tưởng với tiềm năng lớn, có thể đóng vai trò quan trọng trong việc khử carbon của ngành giao thông vận tải. So với nhiên liệu hóa thạch truyền thống, hydrogen xanh chỉ tạo ra nước khi được đốt cháy, không phát thải khí có hại, rất có lợi cho bảo vệ môi trường. Trong lĩnh vực giao thông đường bộ, hydrogen xanh có thể được sử dụng trong các phương tiện chạy bằng pin nhiên liệu (FCVs), ví dụ như ô tô, xe buýt và xe tải hạng nặng. FCVs sử dụng hydrogen và oxy để tạo ra điện thông qua pin nhiên liệu nhằm vận hành phương tiện, mang lại các ưu điểm hiệu suất cao và nạp nhiên liệu nhanh chóng. Trong lĩnh vực hàng không và vận tải biển, mặc dù vẫn còn một số thách thức kỹ thuật, hydrogen xanh và các dẫn xuất của nó, ví dụ như amoniac xanh, cũng được kỳ vọng sẽ trở thành nhiên liệu thay thế sạch trong tương lai, giúp các lĩnh vực này giảm phát thải carbon.