Groen waterstof is een ideale transportbrandstof met groot potentieel, die een sleutelrol kan spelen in de decarbonisatie van de transportsector. In vergelijking met traditionele fossiele brandstoffen produceert groen waterstof alleen water bij verbranding, zonder schadelijke gasemissies, wat zeer gunstig is voor het milieu. In het wegverkeer kan groen waterstof worden gebruikt in brandstofcelvoertuigen (FCV's), zoals auto's, bussen en zware vrachtwagens. FCV's gebruiken waterstof en zuurstof om via brandstofcellen elektriciteit op te wekken en het voertuig aan te drijven, met als voordelen hoge efficiëntie en snelle tanktijd. In de luchtvaart- en maritieme transportsector zijn er nog enkele technische uitdagingen, maar groen waterstof en zijn derivaten, zoals groen ammoniak, worden in de toekomst ook als schone alternatieve brandstoffen verwacht, waarmee deze sectoren hun koolstofuitstoot kunnen verlagen.