Το πράσινο υδρογόνο είναι εξ ορισμού ουδέτερο ως προς τις εκπομπές άνθρακα, καθώς όλος ο κύκλος ζωής του — από την παραγωγή μέχρι την τελική χρήση — δεν παράγει καθόλου καθαρές εκπομπές άνθρακα. Παράγεται με ηλεκτρόλυση του νερού με χρήση ηλεκτρικής ενέργειας από ανανεώσιμες πηγές, όπως η ηλιακή, η αιολική ή η υδροηλεκτρική, καταναλώνοντας μόνο νερό και καθαρή ενέργεια και απελευθερώνοντας οξυγόνο ως παραπροϊόν. Όταν το πράσινο υδρογόνο χρησιμοποιείται — είτε σε κυψέλες καυσίμου για παραγωγή ηλεκτρικής ενέργειας, είτε σε βιομηχανικές διεργασίες ή για θέρμανση — αντιδρά με το οξυγόνο παράγοντας ενέργεια και νερό, χωρίς να εκλύονται διοξείδιο του άνθρακα ή άλλα αέρια του θερμοκηπίου. Αυτός ο κλειστός κύκλος εξασφαλίζει ότι δεν προστίθεται άνθρακας στην ατμόσφαιρα, ξεχωρίζοντάς το από το γκρι υδρογόνο (που παράγεται από ορυκτά καύσιμα με υψηλές εκπομπές) ή το μπλε υδρογόνο (που προέρχεται από ορυκτά καύσιμα αλλά με αναμόρφωση άνθρακα, το οποίο παρουσιάζει ακόμη και υπολειπόμενες εκπομπές). Ως ενεργειακός φορέας ουδέτερος ως προς τις εκπομπές άνθρακα, το πράσινο υδρογόνο είναι αποφασιστικής σημασίας για την επίτευξη των παγκόσμιων κλιματικών στόχων, καθιστώντας δυνατή την αποεμπλοκή τομέων, όπως η βαριά βιομηχανία και ο μεταφορέας εμπορευμάτων μεγάλων αποστάσεων, όπου η άμεση ηλεκτροδότηση είναι δύσκολη.