Žaliasis vandenilis iš prigimties yra anglies neutralus, nes visas jo gyvavimo ciklas – nuo gamybos iki paskutinio panaudojimo – sukelia nulinę grynąją anglies emisiją. Gaminamas vandenį elektrolizuojant naudojant elektros energiją iš atsinaujinančių šaltinių, tokių kaip saulės, vėjo ar hidroenergijos, šis procesas sunaudoja tik vandenį ir švarią energiją, o šalutinis produktas yra deguonis. Kai žaliasis vandenilis yra naudojamas – tiek kuro elementuose gaminti elektros energijai, tiek pramonės procesuose ar šildymui – jis reaguoja su deguonimi, kad būtų gaminama energija ir vanduo, be anglies dvideginio ar kitų šiltnamio efektą sukeliančių dujų emisijos. Šis uždaras ciklas užtikrina, kad atmosfera neįtraukiama jokio anglies, skiriant jį nuo pilkojo vandenilio (gaminamo iš fosilinių kurų, su aukšta emisija) ar mėlynojo vandenilio (iš fosilinių šaltinių, su anglies surinkimu, kuris vis dar turi likutinę emisiją). Kaip anglies neutralus energijos vežėjas, žaliasis vandenilis yra svarbus siekiant pasaulinių klimato tikslų, leidžiant sektoriams, tokiems kaip sunkioji pramonė ir ilgalaikės pervežimų paslaugos, mažinti anglies pėdsaką ten, kur tiesioginė elektrikacija yra sudėtinga.