Dolgoročno shranjevanje zelene vodike je ključni dejavnik za široko uporabo obnovljivih virov energije, saj omogoča obvladovanje sezonske in prekinjene narave virov, kot sta sonce in veter. Zelena vodika, proizvedena z elektrolizo z uporabo električne energije iz obnovljivih virov, se lahko dolgo hranila brez pomembne izgube energije, kar jo naredi idealno za uravnoteženje ponudbe in povpraševanja skozi mesece ali celo sezone. Tehnologije, kot so shranjevanje v kovinskih hidridih, tekočih organskih prenašalcih vodika (LOHC), ali podzemnih solnih jamah, omogočajo to dolgoročno shranjevanje. Kovinski hidridi, na primer, kemično vežejo vodik na kovine, kar omogoča varno shranjevanje v kompaktnih enotah za leta naprej. Ta zmožnost zagotavlja, da se presežek zelene vodike, proizveden v času maksimalne obnovljive proizvodnje (npr. poletna sončna energija), shrani in uporabi v času visokega povpraševanja (npr. pozimska ogrevanja). Dolgoročno shranjevanje zelene vodike tako izboljšuje energetsko varnost, zmanjšuje potrebo po nadomestnih fosilnih gorivih in pospešuje prehod k popolnoma dekarboniziranemu energetskemu sistemu.