Zelený vodíkový PEM elektrolyzér je dôležité zariadenie na výrobu zeleného vodíka. PEM znamená protonovú výmenu cez membránu. Tento typ elektrolyzérov využíva membránu s protonovou výmenou ako elektrolyt, čo má vlastnosti vysokého elektrolytického účinnosti (zvyčajne viac ako 80 %), rýchlej odozvy a výroby vodíka vysokých čistôt. Je veľmi vhodný na spojenie s obnoviteľnými zdrojmi energie, ako sú veterná energia a fotovoltaické elektrárne. Napríklad, keď je pripojený k solárnej elektronickej sústave, môže rýchlo upraviť rýchlosť elektrolyzéru podľa zmeny solárnej energie a efektívne vyrábať zelený vodík. Spoločnosť Accelera dodá pre projekt zeleného vodíka Lingen spoločnosti BP v Nemecku 100 megawattový PEM elektrolyzér, ktorý bude napájaný elektrinou z obnoviteľných zdrojov z offshore veterných elektrární a bude schopný ročne vyrobiť až 11 000 ton zeleného vodíka.