Sistem mikrogrid hidrogen hijau merupakan sistem kecil berskala kecil yang mandiri, menggabungkan pengeluaran, penyimpanan, dan penggunaan hidrogen hijau dengan teknologi mikrogrid. Sistem ini biasanya menggunakan sumber tenaga boleh baharu seperti tenaga suria atau angin untuk menjana elektrik, kemudian menggunakan elektrik ini untuk menghasilkan hidrogen hijau melalui elektrolisis. Hidrogen ini boleh disimpan dalam peranti penyimpanan hidrogen, dan apabila bekalan tenaga boleh baharu tidak mencukupi, hidrogen digunakan dalam sel bahan api untuk menjana elektrik, menyediakan sokongan kuasa yang stabil kepada mikrogrid. Sebagai contoh, Pusat Ketahanan Calistoga di California merupakan fasiliti mikrogrid dan penyimpanan jangka panjang hidrogen hijau berbentuk hibrid, yang menggabungkan sel bahan api hidrogen hijau dan bateri ion litium. Fasiliti ini boleh menyediakan kestabilan grid dan kuasa sandaran sehingga 48 jam semasa gangguan, serta merupakan projek penyimpanan tenaga hidrogen hijau pada skala utiliti terbesar di Amerika Syarikat.